计算与理论化学

计算和理论化学组在波士顿大学世界一流计算资源的支持下,被广泛认为是美国“30强”理论化学项目之一。澳门威尼斯人注册网站研究领域包括量子动力学、光电离和电子分子散射理论、液体动力学过程的经典统计力学和蛋白质结构与动力学。 资源和关系 包括波士顿大学计算科学中心,科学可视化小组,以及大波士顿地区,大西洋原子建模中心。

核心澳门威尼斯人注册网站

Ksenia Bravaya

面积:计算量子化学

Bravaya小组开发了新的理论方法,针对涉及多个电子态的过程,磁场中开壳物质的化学和亚稳系统。他们将这个新的计算工具包,以及现有的最先进的量子化学方法应用于鸟类磁接受机制的澳门威尼斯人注册网站研究,荧光蛋白的光学特性的调整,澳门威尼斯人注册网站研究涉及亚稳电子态的过程,以及探索新的磁性材料的电子结构。目标是开发一个理论化学框架,用于澳门威尼斯人注册网站研究生物分子和新材料(例如,分子电子学/自旋电子学,磁光伏和生物光子学)中的复杂光诱导过程和自旋效应。

大卫·科克

面积:量子动力学和统计力学

Coker小组开发了半经验方法来计算多体系统的电子激发态势能面,以及允许电子跃迁的混合量子经典和半经典分子动力学方法。将这些方法结合起来澳门威尼斯人注册网站研究液体、固体和团簇中的光解动力学,不同环境下的电荷转移反应,以及溶剂对电子态和电子弛豫动力学的影响。

羌族崔

澳门威尼斯人注册网站研究领域:化学和生物物理中的多尺度理论/计算

Cui团队开发并应用了广泛的理论和计算方法(QM/MM,原子和粗粒度模拟,连续体建模)来澳门威尼斯人注册网站研究各种各样的化学和生物问题,特别关注涉及多个长度和时间尺度的问题,如酶催化,生物能/信号转导,生物膜重塑,大分子组装和固体/液体界面。该小组与波士顿大学校园内外的许多实验小组密切合作。

汤姆·凯斯

面积:理论生物物理化学

凯斯小组澳门威尼斯人注册网站研究蛋白质折叠的机制和动力学,配体与蛋白质的结合,病毒的全原子描述,以及相关光谱探针的“实验理论”。他们的主题是:(1)当感应或极化(由局部电场产生的偶极子)被精确地包括在内时,经典力学的广泛适用性。该小组具有非线性红外和拉曼光谱的经典理论,并认为配体的结合是通过经典的静电键发生的;(2)多维势能面或景观理论的形成;(3)针对计算密集型问题开发智能或加速仿真算法。

版约翰Straub写的

澳门威尼斯人注册网站研究领域:生物分子结构与动力学

斯特劳布小组专注于生物分子系统的理论和计算建模。特别感兴趣的领域包括蛋白质中的能量传递和信号动力学,折叠计算算法的发展,蛋白质和膜的热力学和相变,以及肽和蛋白质聚集的建模。

相关的老师

桑德尔·瓦伊达,生物医学工程系,吉恩·斯坦利,物理系

资源与关系

计算科学中心-为澳门威尼斯人注册网站研究人员、教育工作者和学生之间的多学科思想交流提供了一个论坛。CCS提供研讨会、讲习班和专题讨论会,以突出计算科学的进步,并促进基于计算的澳门威尼斯人注册网站研究项目和教育,与来自20个不同部门和中心的科学家合作。

科学计算和可视化组-波士顿大学的高性能计算和可视化系统包括IBM Blue Gene, IBM pSeries 690, IBM pSeries 655,英特尔Pentium III Linux集群,深度视觉显示墙,接入网格会议设施,虚拟环境实验室和计算机图形实验室。

GBA(大波士顿地区)理论化学系列讲座——由波士顿大学、波士顿学院、哈佛大学和麻省理工学院的澳门威尼斯人注册网站研究生和博士后澳门威尼斯人注册网站研究员设计和运营,吸引了理论化学和物理领域的顶尖澳门威尼斯人注册网站研究人员。每月两次的讲座使四所院校的学生能够交流思想,并与来自世界各地学术界的科学家建立关系。主题从密度泛函理论到网络生物学,但大多数集中在理论化学和凝聚态物理。

ACAM(大西洋原子建模中心)-波士顿大学通过ACAM在计算和理论化学方面拥有强大的国际澳门威尼斯人注册网站研究联系。ACAM是“欧洲原子和分子计算中心”(CECAM)的爱尔兰“节点”(都柏林大学学院),由David Coker教授领导(2009-2012)。ACAM旨在利用澳门威尼斯人注册网站研究人员之间的全球联系,使他们能够合作并开始构建新一代算法,以利用最先进的理论和计算工具解决材料,生物和能源科学中的重要挑战。