Ljubomir T. Citkusev， Richard Brower和Charles DeLisi波士顿大学工程学院分子工程澳门威尼斯人注册网站研究实验室
本文从通道蛋白结构的角度对离子在电压门控膜通道中的传播进行了定量建模澳门威尼斯人注册网站研究。
细胞膜上的离子通道是由蛋白质组成的，这些蛋白质选择性地允许离子在细胞内外之间运输。离子通道的功能在控制膜静息电位、体积和细胞的所有电反应方面是至关重要的。
该模型为通道离子流动的MD模拟提供了一种新的有效方法。它是离子流动的三维分子动力学模拟，通过通道蛋白的详细分子结构表示。该模型是一种局部柔性的通道离子传播模拟序列分子动力学算法，在减少远程计算的同时，充分利用了通道蛋白的详细分子结构及其与通过的离子在局部水平上的相互作用。图形显示了离子和水流通过“从头开始”设计的通道蛋白系统的MD模拟数据。该算法的高效性使得仿真实时性可达1毫秒。
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