波士顿大学信息服务与技术部门的澳门威尼斯人注册网站研究计算服务(RCS)小组提供计算和可视化资源和服务,以支持具有专业或高度密集的计算、存储、带宽或图形要求的澳门威尼斯人注册网站研究。典型的应用包括科学和工程仿真、数据分析和可视化。
资源的管理与澳门威尼斯人注册网站研究计算治理委员会、波士顿大学计算科学中心(ccs.bu.edu)和拉菲克B.哈里里计算和计算科学与工程澳门威尼斯人注册网站研究所(bu.edu/hic)密切协商。
MGHPCC
波士顿大学是马萨诸塞州绿色高性能计算中心(MGHPCC)的创始成员之一,该中心是由大学、工业界和马萨诸塞州政府合作建立的。MGHPCC在马萨诸塞州的霍利奥克运营着一个最先进的数据中心,专门为满足其成员的澳门威尼斯人注册网站研究计算需求而设计。该数据中心利用了康涅狄格河上霍利奥克天然气和电力公司水力发电厂的丰富、清洁、可再生能源,拥有一个33,000平方英尺的电脑室,一个19兆瓦的电源,以及一个利用外部空气提供70%冷却的高效冷却装置。MGHPCC已获得LEED白金认证。
合作伙伴包括大学成员波士顿大学、哈佛大学、麻省理工学院、东北大学和马萨诸塞大学;行业合作伙伴思科和EMC;以及马萨诸塞州联邦。
服务模型
RCS提供了几种服务模式,包括共享、购买/合作、专用和共同定位的系统,以集中支持澳门威尼斯人注册网站研究计算,并为澳门威尼斯人注册网站研究人员提供全方位的计算选项,从大学范围内的完全共享资源到专用的、独立拥有和操作的机器。在大多数情况下,这些系统由澳门威尼斯人注册网站研究计算人员集中管理;在所有情况下,mghpc的物理基础设施-空间,电源,冷却和核心网络-都由大学提供,不向个人澳门威尼斯人注册网站研究人员或部门收费。
共享服务模式适用于由大学贡献的大量设备,无论是中央全额资助还是由大量匹配资金杠杆作用的机构级基础设施赠款。这些计算资源在公平分配的基础上免费提供给所有教职员工和澳门威尼斯人注册网站研究人员;拨款由教职员工委员会审查。大学目前维护共享计算集群(SCC)作为共享服务。
购买计划允许澳门威尼斯人注册网站研究人员获得额外的、标准化的计算服务器来支持他们的个人澳门威尼斯人注册网站研究项目。额外的资源被集成到共享设施中,并由RCS组集中管理,设备的所有者被授予优先访问权,而任何多余的计算能力都被返回到池中,供一般共享使用。所有者决定其部分设施的访问和排队策略。存储也可以在购买计划下购买。所有其他标准服务都是免费提供的。
计算设施
位于MGHPCC的共享计算集群是由共享组件和购买组件组成的异构Linux集群。该系统目前包括2500多个共享处理器、4400个购买处理器、236个gpu和超过2 pb的澳门威尼斯人注册网站研究数据存储。
广泛的编程语言、并行编译器、数学和科学库、图形和可视化软件以及特定学科的应用程序包在集群上维护。
除了用于计算的高性能存储系统外,信息服务与技术公司还提供数据归档服务,用于安全、长期存储不经常访问的数据。
网络
波士顿大学在校内运行高性能网络以及与新英格兰地区和世界连接方面有着悠久的历史。
波士顿大学是internet - 2的成员,它维护国家网络(100gb /s),以支持澳门威尼斯人注册网站研究和教育。该大学也是北方十字路口(NoX)的创始成员,该组织维护区域网络(10gb /s),并作为新英格兰参与者和商品互联网服务提供商的高性能交换。NoX在MGHPCC运行一个节点,并为安装在MGHPCC的成员设备提供Meet-Me互连。
该大学连接到地铁环144光纤在7.4英里半径通过波士顿和剑桥。
校园核心利用10千兆以太网,与波士顿/剑桥NoX节点有多个10千兆链路,并与MGHPCC有一对10千兆连接。RCS使用InfiniBand、万兆以太网和千兆以太网来互连其计算系统。
可视化
RCS提供图形和虚拟现实设备以及员工专业知识,以支持广泛的澳门威尼斯人注册网站研究应用领域。
计算机图形实验室拥有运行科学可视化、分子设计、图形、建模和动画软件的Windows和Linux工作站。
咨询
澳门威尼斯人注册网站研究计算广泛训练有素的员工协助澳门威尼斯人注册网站研究和教育界的成员推进澳门威尼斯人注册网站研究和教育。
科学编程顾问在程序并行化、性能测量和代码调优以及数值方法和计算技术方面提供帮助。
系统顾问帮助使用超级计算系统及其各种编程工具和软件包,以及数据管理。
图形顾问协助澳门威尼斯人注册网站研究人员开发可视化、虚拟环境和图形问题解决。它们涵盖了图形和可视化软件包的使用,定制计算机图形工具的开发,图形算法的应用,将数据转换为有效的图形表示,以及创建虚拟环境。
训练
RCS提供针对BU安装细节定制的实时和在线教程。每学期提供一个实时教程系列,涵盖编程语言,高性能计算,数学和数据分析,以及科学可视化。根据要求,Research Computing澳门威尼斯人注册将为课程和研讨会定制演示文稿,并主办讲习班、用户组、专题讨论会和供应商培训会议。
软件
SCC上的软件支持使用数据并行、消息传递和共享内存范例开发并行程序。FORTRAN和C的并行编译器,以及数学和科学的子程序库都是可用的。其他软件包可用于分布式计算、统计、科学可视化、建模和渲染、动画、图像处理和绘图。该软件的全面帮助页面是专门为开始使用SCC而编写的。
编程语言
- C
- c++
- FORTRAN (F77, F90, F95)
- 高性能FORTRAN
- Python
- CUDA
并行库
- OpenMP
- 消息传递接口(MPI)
作业管理
- 开放网格调度器-负载平衡器和批处理管理器(Linux)
数学,数据分析和绘图
- 具有图形显示的数学符号包
- MATLAB和MATLAB pct数学和工程包
- maple交互式计算机代数系统
- 交互式数据语言(IDL) -数据分析和可视化包
- Gnuplot-plotting包
- Xmgrace-plotting包
统计数据
- r统计分析和绘图包
- sas统计分析包
- 统计分析包
生物信息学
- 生物传导-高通量基因组数据分析
- CASAVA-Illumina流水线测序后分析
- gatk -下一代重测序分析
- MaCH/ minimac-Markov链单倍型
- PLINK/ seq全基因组关联分析
- Tuxedo工具- rna - seq工具集
科学与工程
- CHARMm-molecular建模
- Gaussian-quantum化学
- Accelrys Discovery studio -分子建模和模拟
- 计算机辅助工程与分析
地理信息系统(GIS)
- ENVI/ idl -地理空间分析和可视化
- 量子地理信息系统——开源地理信息系统
- 地理空间数据抽象库
可视化
- vtk可视化工具库
- ParaView-visualization应用程序
- 视觉分子动力学
动画和图形
- Autodesk玛雅建模和动画软件
- openscenegraph -高性能图形工具包
- OpenGL/ GLUT-3D直接渲染库和窗口工具
- imp图像处理程序
- imagemagick -图像处理程序
联系信息
澳门威尼斯人注册网站研究计算服务信息服务与技术2卡明顿商场,套房105波士顿,MA 02215电子邮件:rcs@bu.edu /tech/support/research/
如果您需要通过电话或在紧急情况下与某人取得联系,请致电IT帮助中心617 353-4357。
波士顿大学的政策规定了在就业和大学所有项目录取方面的平等机会和平权澳门威尼斯人注册行动。