Guanglan张
副教授，计算机科学健康信息项目协调员计算机科学主席
他的澳门威尼斯人注册网站研究重点是生物医学和医疗保健领域的机器学习、数据挖掘和知识管理。她的主要澳门威尼斯人注册网站研究兴趣包括复杂生物过程的计算建模，例如疫苗靶点的识别，下一代生物数据库快速开发框架的开发，从生物医学数据中构建模式识别的分析工具，以及诊断工具的设计。她撰写了三十多篇期刊出版物，开发了二十多个在线计算系统，并作为共同发明人申请了两项专利。通过开发先进的计算解决方案，她为基础和应用生物学和生物医学的快速发展做出了贡献。曾任哈佛医学院副澳门威尼斯人注册网站研究员、丹娜-法伯癌症澳门威尼斯人注册网站研究所高级生物信息学工程师、新加坡信息通信澳门威尼斯人注册网站研究所（前称肯特岭数字实验室）项目负责人和高级澳门威尼斯人注册网站研究工程师。
课程
- 健康信息学
学术作品
Huiting， L. N., Samaha， Y., Zhang， G. L., Roderick， J. E., Li， B., Anderson， N. M., Wang， Y., Laroche， F. J. F., Choi， J. W., Liu， C. T., Kelliher， M. A., Feng， H. “ UFD1通过抑制促凋亡未折叠蛋白反应参与myc介导的白血病侵袭性。”白血病（新闻报道）。
Yoshizawa， A, Bi， K, Keskin， D. B, Zhang， G., Reinhold， B.和Reinherz， E. L.，“TCR - pMHC遭遇对组织驻留CD8 T细胞转录组的差异调节。”欧洲免疫学杂志，第48期。1(2018): 128-150。
Olsen， L. R., Tongchusak， S., Lin， H., Reinherz， E. L., Brusic， V., Zhang， G. L.，“肿瘤T细胞抗原的综合数据库”。癌症免疫学，免疫治疗，66,no。6(2017): 731-735。
裴杰，hidehima， T.，张国良，周杰，Keskin， D., Munshi， N., Anderson， K.，“HLA-A24特异性XBP1， CD138 （Syndecan-1）和CS1 （SLAMF7）肽诱导抗原特异性记忆细胞毒性T淋巴细胞的鉴定和表征”。白血病32(2017):752-764。
Hoft， D. F, Xia， M., Zhang， G. L., Blazevic， A., Tennant， J., Kaplan， C., Matuschak， G., Dube， T. J., Hill， H., Schlesinger， L. S., Andersen， P. L., Brusic， V.，“人类接种PO和ID卡介苗诱导不同的粘膜和全身免疫反应和CD4+ T细胞转录分子特征。”粘膜免疫学（2017）。
Olsen， L.R, Kudahl， U.J, Simon， C, Sun， J, Schönbach， C, Reinherz， E.L, Zhang, g.l., and Brusic， V.，“BlockLogo：多肽和序列基序保护的可视化”。免疫学杂志400-401(2013):37-44。
Yamada， T., Muta， E., Kim， J., Azuma， K., Sugawara， S., Zhang, g.l.l, Matsueda， S., Yamashita， Y., Itoh， K., Hoshino， T.和Sasada， T.“EGFR T790M突变作为免疫治疗的可能靶点；来自EGFR T790M突变的HLA-A*0201限制性T细胞表位的鉴定PLOS One， 8号。11 (2013): e78389。
Riemer， A.B, Keskin， D.B, Zhang， G.L, Handley， M.I, Anderson， K.S, Brusic， V., Reinhold， B.和Reinherz， E.L.“一个保守的e7衍生的CTL表位在人乳头瘤病毒-16转化HLA-A2+人上皮癌中的表达。”生物化学杂志，第285期。38（2010年9月）。
林红辉，张国良，佟楚萨克，S., Reinherz， E.L, Brusic， V.，“MHC-II肽结合预测服务器的评估：在疫苗澳门威尼斯人注册网站研究中的应用”。生物信息学杂志，2008年12月第12期：522。
Khan， A.M, Miotto， O., Nascimento, e.j., Srinivasan, k.n., Heiny, a.t., Zhang， G.L, Marques, e.t., Tan, t.w., Brusic， V., Salmon， J.和August， J.T.“登革热病毒蛋白的保存和变异性：对疫苗设计的影响”。《公共科学图书馆被忽视的热带病》第2期。[j](2008): 383。
张国良，Khan， A.M, Srinivasan, k.n., Heiny， A.T, Lee， K.X., Kwoh, c.k., August， J.T，和Brusic， V.，“热点猎人：病原体蛋白质组中候选免疫热点的大规模筛选和选择的计算系统。”BMC Bioinformatics, vol . 1（2008年2月）：S19。
Heiny, a.t., Miotto， O., Srinivasan， K.N., Khan， A.M, Zhang， G.L., Brusic， V., Tan， T.W., August， J.T.“禽流感和人类流感病毒的进化保守蛋白序列，作为疫苗靶点”。PLOS ONE 2, no。11（2007年11月）：e1190。
Bozic张G.L。,我,Kwoh, C.K。8月,j.t., Brusic,诉”的预测Supertype-Specific HLA类我使用支持向量机结合肽。”免疫学杂志，第320期。1-2 (March 2007): 143-154。
Chong， A., Zhang， Z., Choi, k.p., Choudhary， V., Djamgoz， M.B, Zhang, g.l.和Bajic， v.b。启动子谱分析和共表达数据分析确定了24个与AMPA受体基因gras共调节的新基因。”基因组学，89，不。3(2007): 378-84。
Rajapakse， M., Zhang， G.L, Srinivasan， K.N., Schmidt， B., Petrovsky， N.和Brusic， V.，“PREDNOD，一个非肥胖糖尿病小鼠h - 27g单倍型肽结合的预测模型。”自体免疫39不是8(2006): 645-50。
张志辉，高志勇，张国良，周克辉，Tammi， M.T和Tong， J.C.“过敏原工具：预测蛋白质过敏原性和过敏交叉反应性的Web服务器”。生物信息学，第23期。4(2006): 504-6。
张国良，Petrovsky， N., Kwoh, c.k., August， J.T, and Brusic， V.“PREDTAP：预测抗原加工相关的人类转运蛋白与肽结合的系统”。《免疫组学澳门威尼斯人注册网站研究》第2期。1(2006): 3。
Cocquet， J., Chong， A., Zhang, g.l.和Veitia， R.A.“逆转录酶模板转换和错误替代转录本”。基因组学88，不。1(2006): 127-31。
Tong， J.C c, Zhang， G.L l, Tan， T.W., August， J.T t, Brusic， V.和Ranganathan， S.“HLA-DQ3.2β配体的预测：II类结合肽的多重登记的证据。”生物信息学22(2006):1232-1238。
张国良，Khan, a.m., Srinivasan, k.n., August, j.t.和Brusic， V.“预测病毒疫苗靶点的神经模型”。生物信息学与计算生物学学报，第3期。5(2005): 1207-1225。
张国良，Khan， A.M, Srinivasan, k.n., August， J.T，和Brusic， V.，“MULTIPRED：预测混杂HLA结合肽的计算系统”。核酸澳门威尼斯人注册网站研究33 (2005):W172-W179。
Zhang， G.L, Srinivasan， K.N., Veeramani， A., August， J.T和Brusic， V.，“PREDBALB/c：预测肽与H2d分子结合的系统，BALB/c小鼠的单倍型。”核酸澳门威尼斯人注册网站研究33 (2005):W180-W183。
Srinivasan, k.n., Zhang, g.l., Khan, a.m., August， J.T.和Brusic， V.“I类t细胞表位的预测：抗原内免疫热点存在的证据”。生物信息学学报，2004,(1):397 - 397。
张国良*，张国良*，张国良*，Bajic V.B.“ICE (Information for Exons Coordinates of Exons)：人类剪接位点数据库”。基因组学84(2004):762-766。（*这些作者对这项工作贡献相同）
张国良，张国良，张伟波，Bajic V.B.，“FIE2：人类基因起始点和翻译起始点附近基因组DNA序列的提取程序”。《核酸澳门威尼斯人注册网站研究》第31期。13(2003): 3546-3553。
张广良，张晓明，张晓明，“人类基因5′端和翻译起始位点的信息和序列提取”。计算机生物学2(2002):462-465。
Brusic， V., Petrovsky， N., Zhang, g.l.，和Bajic， V.B.，“结合HLA I类分子的混杂肽的预测”。免疫学与细胞生物学，第80期。3(2002): 280-285。
Bajic, v.b.b, Seah， S.H, Chong， A.，张国良，Koh， J.L.Y，和Brusic， V.，“龙启动子的发现：脊椎动物RNA聚合酶II启动子的识别。”生物信息学18，第2期。1(2002): 198-199。
Abeyratne， U.R, Zhang, g.l.和Saratchandran， P.“脑电图源定位：经典方法和神经网络方法的比较澳门威尼斯人注册网站研究”。国际神经系统学报，第11期。4(2001): 349-359。
Tun, a.k., Lye, n.t., Zhang, g.l.l, Abeyratne， U.R, and Saratchandran， P.“定量电生理学中RBF网络的源定位”。生物医学工程评论28(2000):463-472。
摘要
Finstad, s.l., Zhang, g.l., Linde， C, Muik， A, Hermann， F, Evans， V, de la Rosa， M, Zahn， R, Gaufin， T, Reimann， K, Apetrei， C, Miller， C, McCune， J, Picker， L, Veazey， R, Brusic， V, Letvin， N, Schmitz，J。FC γ受体多态性对恒河猴抗体介导淋巴细胞耗竭疗效的影响医学灵长类学杂志，第39期。4(2010): 279 -280。
Biernacki， M., Alonso， A., Zhang, g.l., Zhang, w.d., Tai， Y.T., Munshi， N., Alyea, e.p., Soiffer, r.j., Brusic， V., Ritz， J., Anderson， K.C, and Wu， C.J.“DAPK2和PIM1是骨髓瘤相关抗原，可在同基因HSCT后引发协调的B细胞和T细胞免疫。”血液（ASH年会摘要）114，第114期。22(2009): 2445。
Biernacki， M., Zhang, g.l., Zhang, w.d., Brusic， V., Soiffer, r.j., Neuberg， D., Alyea, e.p., Tai, y.t., Munshi, n.c., Ritz， J., Anderson, k.c., and Wu， C.J.“在成功的同基因造血干细胞移植的背景下发现的新型骨髓瘤相关抗原”。血液（ASH年会摘要）112，第2期。11(2008): 815。
书的章节
王永生，张广良，吴志强，张志强，“预测hla肽结合的极限学习机器”。计算机科学学报（自然科学版），2006(6):716-721。
Bozic， I., Zhang, g.l., and Brusic， V., <预测疫苗学：使用支持向量机分类器的预测优化> 。计算机科学学报，2005,30(5):379 -381。
Zhang， G.L. Abeyratne， U.R, and Lee， T.H.，“脑电图源定位中经典与神经网络技术的系统比较”。生物力学和生物医学工程中的计算机方法-3，由Middleton， J., Jones, m.l.和Pande， G.N. Gordon & Breach Science出版社编辑，荷兰阿姆斯特丹（2000）。
会议文章
Long， J, Zhang， Y., Brusic， V., Chitkushev， L., Zhang， G.L.，“解毒剂应用：治疗常见毒素过量的教育系统”。ACM-BCB，波士顿，马萨诸塞州， 2017年8月20-23日。由乔恩·朗介绍。
Zhang， P., Chitkushev， L., Brusic， V., and Zhang， G.L.，“免疫学中的生物标志物：从概念到应用。”生物信息学，计算生物学和生物医学信息学国际会议（ACM-BCB）。2013年9月22日至25日，华盛顿特区。
孙洁，张国良，Olsen, l.r.e, Reinherz， E.L，和Brusic， V.“登革热病毒单克隆抗体中和性评估的景观”。生物信息学，计算生物学和生物医学信息学国际会议（ACM-BCB）。2013年9月22日至25日，华盛顿特区。
张国良，Riemer， A., Keskin， D.B., Chitkushev， L., Reinherz, e.l.和Brusic，V.。HPVdb：基于t细胞的人乳头瘤病毒疫苗靶点发现的数据源和分析平台。生物信息学，计算生物学和生物医学信息学国际会议（ACM-BCB）。2013年9月22日至25日，华盛顿特区。
张国良，李建伟，张国良，Zlateva， T.“CDNA贴片微阵列探针信号的数据清洗：异常值检测、降噪和非信息性探针在HLA分型中的应用”。生物信息学和生物医学信息学在治疗学中的应用研讨会（亚特兰大，乔治亚州）， 2011): 682。
Brusic， V., Chitkushev， L., Kalathur， S., Zhang, g.l, and Zlateva， T.，“用于呈现和分析全球疫苗靶点景观的可视化工具”。生物信息学和生物医学信息学在治疗学中的应用研讨会（亚特兰大，乔治亚州）， 2011): 683-88。
张国良，张国良，张国良，“信息技术项目中的综合健康信息学课程”。第六届计算机科学与计算机科学教育国际会议论文集。慕尼黑，德国（2010）：204‐216。
张国良，佟建昌，张振华，郑勇，August，J.T.， Kwoh， C.K和Brusic， V.“基于信息论和支持向量机的混杂HLA-B7粘合剂识别计算模型”。生物医学与制药工程国际会议，新加坡，2006。
张国良，许志强，张志强，吴志强，August， J.T t, Brusic V.“MULTIPRED1在MHC I类结合物预测中的性能评估”。生物医学与制药工程国际会议，新加坡，2006。
Bajic, v.b., Koh， J.L.Y, Chong， A., Seah, s.h., Zhang, g.l.，和Brusic， V.“龙启动器查找器”。1.2e：寻找和分析启动子的系统。生物医学2001，新加坡，文摘（2001）：19-21。
张国良，Abeyratne， U.R和Saratchandra， P.“比较RBF和BPN神经网络在偶极子定位中的应用。”首届BMES/EMES联合会议论文集，服务人类，推进技术。亚特兰大,乔治亚州。（1999年10月13-16日）：939。
Adnan, s.m., Abeyratne, u.r., and Zhang， G.L.，“多束神经的位置选择性刺激”。首届BMES/EMES联合会议论文集，服务人类，推进技术。亚特兰大,乔治亚州。（1999年10月13-16日）：480。
海报
张国良，Khan, a.m.，和Brusic， V.，“对抗登革热：计算机辅助疫苗设计”。2005年9月19日，首届SERC Inter-RI PosterSymposium。
张国良，Bozic， I, Kwoh， C.K，和Brusic， V.“MULTIPRED：一种预测混杂HLA I类结合物的计算系统。”第二届国际免疫信息学研讨会和免疫信息学研讨会（IIMMS2005）。波士顿,质量。2005年3月7日至9日。
张国良，张国良，Khan, m . m ., Srinivasan， K.N., August， J.T t ., Tan， T.W., Brusic， V.，“登革热病毒抗原热点分析：生物信息学方法”。第一届亚洲区域登革热澳门威尼斯人注册网站研究网络会议。泰国曼谷，2004年10月18日至20日。
张国良，郭志强，张志强，吴志强，“一种预测混杂HLA I类结合物的计算系统”。“第八届NUS-NUH年度科学会议。新加坡国立大学，2004年10月7日。
张国良，张建平，张建平，张建平，“人类基因5′端序列信息的提取”。生物信息学和基因组澳门威尼斯人注册网站研究会议，2002年6月2-7日，加州圣地亚哥。
Bajic, v.b., Koh， J.L.Y, Chong， A., Seah, s.h., Zhang, g.l.，和Brusic， V.“龙启动器查找器”。1.2e：寻找和分析启动子的系统。生物医学，2001年，新加坡。
开发生物信息学系统
SprPred：用于大规模筛选等位基因、基因型和超型特异性HLA相关肽的系统。
肿瘤T细胞抗原数据库：一个癌症疫苗靶点发现的数据来源和分析平台，重点关注包含HLA配体和T细胞表位的人类肿瘤抗原。
黄病毒抗原数据库：黄病毒免疫靶点发现的数据来源和分析平台，重点关注含有交叉保护性T细胞和B细胞表位的抗原。
甲型流感病毒抗原数据库：通过关注含有交叉保护性T细胞和B细胞表位的抗原，发现甲型流感病毒免疫靶点的数据源和分析平台。
FcgR恒河猴基因数据库：支持恒河猴fc γ-受体多态性对单克隆抗体介导的淋巴细胞耗竭和sivmac251设定点病毒血症影响分析的数据来源。
eb病毒T细胞抗原数据库：一个eb病毒免疫靶点发现的数据来源和分析平台，重点关注含有HLA配体和T细胞表位的eb病毒抗原。
人乳头瘤病毒T细胞抗原数据库：通过关注包含HLA配体和T细胞表位的HPV抗原，发现HPV免疫靶点的数据源和分析平台。
predafa：一个用于食蟹猴MHC等位基因结合肽的计算机识别系统
ConeSnail数据库：它促进了对不断扩大的海锥蜗牛毒液的con多肽的管理，并代表了该领域的生物信息学方法，以进一步发展con多肽在人类治疗中的应用。
MULTIPRED：用于预测混杂HLA结合肽的计算系统
MULTIPRED版本1：用于预测混杂HLA结合肽的计算系统
PREDBALB/c：用于预测肽与H2d分子结合的系统，H2d是BALB/c小鼠的单倍型
热点猎人：用于预测和分析t细胞表位热点的计算系统
PREDTAP：一个预测多肽与抗原加工相关转运体结合的计算系统。
PREDNOD：一个预测非肥胖糖尿病（NOD）小鼠（胰岛素依赖型糖尿病（IDDM）的动物模型）主要组织相容性复合体单倍型（H2-Ag7,H2-Db,H2-Kd）肽结合的系统。
5 '端信息提取（FIE）：一种提取人类基因起始位点和翻译起始位点周围基因组DNA序列的系统
ICE (Information for Coordinates of Exons)：一个人类剪接位点数据库
邀请谈判
“预测结合HLA I类分子的混杂肽。第一届沙特阿拉伯生物信息学研讨会，利雅得，沙特阿拉伯，2006年2月。
“预测结合HLA I类分子的混杂肽。”2005年11月，巴基斯坦拉合尔，FAOBMB生物信息学卫星研讨会。
口头报告和演示
MULTIPRED：一个用于预测混杂HLA I类结合物的计算系统。第三届亚太生物信息学会议（APBC2005）澳门威尼斯人注册网站研究生卫星研讨会。南大，新加坡，2005年1月。
MULTIPRED软件演示。第三届亚太生物信息学会议（APBC2005），新加坡，2005年1月
I类t细胞表位的预测：抗原内存在免疫热点的证据。第12届分子生物学智能系统国际会议，与欧洲计算生物学会议（ISMB/ECCB2004）。格拉斯哥，苏格兰，2004年8月。
病毒T细胞表位的预测建模。新加坡免疫信息学研讨会：从数据库到疫苗，2004年3月1日。
“预测病毒疫苗目标的神经模型。”神经计算与智能进化会议2003 （NCEI 2003）。新西兰奥克兰，2003年11月。
资助
“下一代免疫原性预测工具的开发”。辉瑞公司150000美元。Vladimir Brusic（首席澳门威尼斯人注册网站研究员）和Guanglan Zhang（联合澳门威尼斯人注册网站研究员）
澳门威尼斯人注册网站的问答
你的专业领域是什么？我在生物信息学和健康信息学方面有广泛的背景。我的专长包括复杂生物过程的计算建模，例如疫苗靶点的鉴定，以及生物医学数据的分析，包括质谱（MS），微阵列和测序数据。我的经验还包括从这些数据中构建用于模式识别的分析工具，开发下一代生物数据库，设计诊断工具，实现支持临床决策的医疗算法，从社会经济数据挖掘中发现知识，以及构建支持医疗保健需求的计算基础设施。
在波士顿丹娜法伯癌症澳门威尼斯人注册网站研究所（Dana-Farber Cancer Institute， DFCI）工作期间，为了促进高效的大规模数据收集、整合、存储和分析，我开发了一个名为KB-builder的框架，用于快速开发下一代生物数据库。KB-builder是模块化的，可以快速部署到任何涉及生物数据存储、检索、注释和分析的项目中。它已被应用于多个项目（HLA基因分型、eb病毒、默克尔细胞多瘤病毒、甲型流感病毒、黄病毒、人乳头瘤病毒和肿瘤t细胞抗原）。我在DFCI工作期间开发的大多数在线生物信息学系统不仅被DFCI的同事使用，还被从事免疫学和癌症疫苗工作的澳门威尼斯人注册网站研究人员和实验室使用。
来到波士顿大学后，你关注的重点是什么？自从搬到波士顿大学后，我将我的澳门威尼斯人注册网站研究兴趣扩展到健康信息学领域，并在MET的健康信息学澳门威尼斯人注册网站研究实验室领导澳门威尼斯人注册网站研究活动。我们与具有药剂学背景的硕士澳门威尼斯人注册网站研究生Jon Long一起开发了解毒剂应用程序（AA），这是一个计算系统，可以自动提供针对患者的解毒剂治疗建议和个体化剂量计算。据我们所知，AA是毒理学领域第一个教育决策支持系统，可以提供针对特定患者的治疗建议和药物剂量计算，它可以作为一个独立的临床决策工具或作为电子健康记录系统的一个组成部分。我在多个会议上介绍了我们的工作，并邀请了演讲。
电子数据采集（EDC）用于促进临床澳门威尼斯人注册网站研究和医学监测数据的快速、准确和无错误收集。具有异步数据传输层的全功能移动EDC （mEDC）解决方案将更好地满足资源受限地理区域分布式澳门威尼斯人注册网站研究的需求。与具有多年软件开发经验的硕士澳门威尼斯人注册网站研究生Caleb Ruth一起，我们开发了ConnEDCt，这是一个功能齐全的mEDC应用程序，可针对各种纵向澳门威尼斯人注册网站研究协议进行定制，具有符合法规的安全性，可审计性和异步数据传输模型，允许与基于云的服务器进行临时同步。目前，康奈尔大学的一组澳门威尼斯人注册网站研究人员正在印度的一项临床试验中使用ConnEDCt作为数据捕获工具。
请给我们讲讲你的工作。你能分享一下最近的澳门威尼斯人注册网站研究或出版物吗？去年，我开始与波士顿大学医学院埃文斯转化流行病学和比较有效性中心主任Bindu Kalesan博士合作，使用队列方法对暴力和创伤事件（EVE）的影响进行纵向澳门威尼斯人注册网站研究。我们组建了一个由四名MET硕士生组成的软件开发团队，并开发了一个原型网站来支持这项澳门威尼斯人注册网站研究（everesearch.org）。
在我从事生物医学科学澳门威尼斯人注册网站研究的二十年中，我撰写了五十多篇期刊出版物，开发了二十多个在线计算系统，并作为共同发明人申请了两项专利。我在支持临床澳门威尼斯人注册网站研究、生物医学数据挖掘和知识发现的在线计算系统和数据库的开发方面有良好的记录。我开发的计算工具已经被用于癌症、免疫学、疫苗学、毒理学和传染病的澳门威尼斯人注册网站研究。通过开发先进的计算解决方案，我为生物医学和健康信息学的快速发展做出了贡献。
今年3月，我应邀在中国做了几次演讲。在北京大学人民医院，我介绍了“TANTIGEN：肿瘤T细胞抗原的综合数据库”。然后，在成都举行的2018“华西国际医学谷”建设研讨会上，题为“临床决策支持系统与循证医学-解毒剂应用：一种治疗常见毒素过量的系统”。
我最近发表了几篇文章，你们可以在我的教员简介页面上看到。
你教什么课程？我是健康信息学计划的澳门威尼斯人注册网站协调员，在那里我教生物医学科学和健康IT （MET CS 570）和健康信息学（MET CS 580）。我还教授R分析基础（MET CS 544）， R数据分析和可视化（MET CS 555），以及网络分析和挖掘（MET CS 688）。
请强调你的学生最感兴趣的课程项目。cs580的学期项目要求学生理解所选医学算法的逻辑。考虑到一些学生没有编程背景，我们不要求学生实现算法。但是，前几个学期的一组学生确实将CS 580学期项目与他们的软件工程学期项目（MET CS 673）结合起来，并实施了一个模拟II型糖尿病治疗临床决策过程的在线系统。学生们在2015年计算机科学与计算机科学教育（CSECS）会议上展示了这项工作。