2017年iGEM大会上,大学生合成生物学项目获得认可

莉兹·希利著

来自波士顿大学的两个学生团队在2017年国际基因工程机器(iGEM)巨人大会上获得了科学成就的认可。

上个月,iGEM接待了来自44个国家的3000多名与会者,他们在波士顿的海因斯会议中心展示了自己的作品。iGEM是一个非营利性组织,Jamboree是他们为想要探索合成生物学澳门威尼斯人注册网站研究的学生举办的年度比赛。比赛是经过8个月的严格澳门威尼斯人注册网站研究的高潮,参赛队伍的评判标准包括口头陈述、海报、团队Wiki以及与评委的问答环节。波士顿大学Wet Lab和BostonU Hardware两支队伍分别获得银奖和金奖,Hardware团队还获得了最佳硬件项目奖。

The BostonU Wet Lab Team (from left to right), Shuyi Xu (BME ’19), Stephen Tucker (BME ’20), Madeline Simota (BME ’20), Thomas Costa (BME ’18), Abigail Sasdelli (BME ’18,. and Saimrunali Dadigagla (BME ’20), with Associate Professor Douglas Densmore (ECE, BME) at the iGEM Jamboree.
波士顿大学湿实验室团队(从左至右),Shuyi Xu (BME ' 19), Stephen Tucker (BME ‘ 20), Madeline Simota(生物学’ 20),Thomas Costa (BME ' 18), Abigail Sasdelli (BME ' 18)和Saimrunali Dadigagla (BME ' 20),与副教授Douglas Densmore (ECE, BME)在iGEM Jamboree。

Douglas Densmore副教授(欧洲经委会,BME)说:“两个团队都展示了合成生物学如何用于执行传统上与生物系统无关的计算概念。”“他们的成功证明了他们的努力以及澳门威尼斯人注册网站研究生导师的奉献和领导能力。”Densmore教授与Wilson Wong助理教授(生物工程系)和Daniel教授(生物信息学)是团队的顾问之一。

硬件团队的项目,合成生物学澳门威尼斯人注册网站研究的微流控应用(MARS),旨在为合成生物学家增加被称为微流控芯片的设备的可访问性和可用性。这些芯片使澳门威尼斯人注册网站研究人员能够进行更小规模的实验——这意味着供应更远,结果产生更可靠——这只是一系列好处中的一部分。但制造这些芯片需要昂贵的设备和高度专业化的知识。为了帮助合成生物学家克服这些障碍,该团队开展了三个项目:微流体101、火星储存库和流体功能。这些项目一起提供了微流体的深入指南,包括故障排除技术。

The BostonU Hardware Team (from left to right), Dinithi Samarasekera (BME ’20), Dylan Samperi (BME, CE ’19), and Sarah Nemsick (BME ’20), display their award for Best Hardware Project at the iGEM Jamboree.
波士顿大学硬件团队(从左到右),Dinithi Samarasekera (BME ' 20), Dylan samperry (BME, CE ' 19)和Sarah Nemsick (BME ' 20)在iGEM Jamboree上展示了他们获得的最佳硬件项目奖。

硬件团队的成员Dylan samperry (BME, CE ' 19)说:“在我们的课程中,我们学习工程原理,但iGEM是一个很好的机会,让我们了解真正进入工程和开发人们实际使用的系统的内容。”

Dinithi Samarasekera (BME ' 20)从高中开始就对合成生物学感兴趣,当时她了解了黄金大米,这是一种用于对抗营养不良和维生素a缺乏症的新水稻品种。她作为一名新生加入iGEM,没有任何本科澳门威尼斯人注册网站研究经验,但“在iGEM,尤其是在我们的实验室,你被要求非常高的标准,所以这是一个磨练我的澳门威尼斯人注册网站研究技能和了解这个领域真正需要什么的好机会。”练习制作东西,然后测试和解决问题,这真的很有意义。”

硬件团队的成员包括Samperi, Samarasekera和Sarah Nemsick (BME ' 20)。他们的导师是欧洲经委会澳门威尼斯人注册网站研究生Josh Lippai。

湿实验室团队的项目是建立一个生物电路,可以有效地确定细胞的状态,在这种情况下,如果这种状态表明癌症的存在,通过测量细胞内某些遗传物质的水平。当细胞癌变时,某些遗传物质链的表达谱会发生变化,澳门威尼斯人注册网站研究人员可以检测到这些变化。但不同的癌症产生不同的表达范式,澳门威尼斯人注册网站研究人员通常需要测量数千个标记来对细胞进行分类。通过一系列的生物开关,新的电路将能够简化这一过程,并在无细胞的环境中运行。从长远来看,这项技术的潜力将是通过简单的血液测试来诊断癌症。

“参加iGEM真的教会了我如何解决问题,因为我们必须弄清楚哪里出了问题,如何控制实验,下一步该怎么做,”阿比盖尔·萨斯德利(BME ' 18)说。“这比我以前的经历更具挑战性,也更发人深省,因为我能够学习如何做澳门威尼斯人注册网站研究,而不仅仅是被告知该做什么。”

湿实验室团队的成员包括Sasdelli, Thomas Costa (BME ' 18), Shuyi Xu (BME ' 19), Stephen Tucker (BME ‘ 20), Madeline Simota(生物学’ 20)和Saimrunali Dadigagla (BME ' 20)。该团队由生物信息学澳门威尼斯人注册网站研究生Alan Pacheco和BME澳门威尼斯人注册网站研究生Matthew Brenner指导。

这两个团队都是美国国家科学基金会生活计算项目及其外展计划STEM路径的澳门威尼斯人注册网站研究组成部分。