Andrew Emili领导网络系统生物学新中心
蛋白质组学专家旨在创建“高度协作的多学科澳门威尼斯人注册网站研究中心”

Andrew Emili是医学院生物化学系和中科院生物学系的联合教授,他是新成立的全校网络系统生物学中心的主任。西德尼·斯科特摄
在麦吉尔大学(McGill University)读本科时,安德鲁·埃米尔(Andrew Emili)靠组装宜家家具赚钱。组装说明可能会阻碍他的客户,但至少说明书是存在的。这比Emili目前面临的挑战更有意义:绘制人类基因组中编码的数万种蛋白质之间的相互作用网络。
2017年7月从多伦多大学来到波士顿大学的分子系统生物学家Emili说:“这就像你在组装宜家家具时弄丢了组装说明。”“你看到螺栓,你看到孔,你知道两者之间的关系,但不知道哪个通向哪里。”
Emili被联合任命为波士顿大学医学院(MED)生物化学系和艺术与科学学院(CAS)生物系的主任,是新成立的全校网络系统生物学中心(CNSB)的主任。
他说,人类的健康和发育取决于蛋白质相互作用的网络。然而,尽管基因组学进展迅速,但科学家们对这些相互作用如何起作用以及错误的相互作用如何导致疾病知之甚少。Emili使用蛋白质组学,澳门威尼斯人注册网站研究基因的蛋白质产物,以及质谱,生物信息学和其他分子遗传学和基因组学技术,来创建蛋白质相互作用的图谱。然后,他制作了他的地图,他将其描述为分子网络的组装指令,供更广泛的澳门威尼斯人注册网站研究界使用。他说,他的最终目标是将这些基础知识转化为新的诊断和治疗工具,用于癌症、心血管疾病、阿尔茨海默病和其他神经退行性疾病。
他说,他对CNSB的愿景是“创建一个高度协作的多学科澳门威尼斯人注册网站研究中心,通过与波士顿大学、大波士顿地区和世界各地感兴趣的澳门威尼斯人注册网站研究人员建立新的联系,解决该领域的重要基础问题。”
Emili被广泛认为是蛋白质组学、质谱学和网络系统生物学的领导者,医学教授兼生物化学主席David Harris说。他说Emili在质谱方面的工作将补充Catherine E. Costello的工作,Catherine E. Costello是William Fairfield Warren杰出教授、医学生物化学教授、波士顿大学生物医学质谱中心主任。哈里斯说,随着Emili的到来,“我们在多种质谱分析领域拥有了令人难以置信的强大影响力。”
虽然CNSB和Emili的实验室将被安置在生物化学系内,但他将作为医学院和查尔斯河校区之间的桥梁,并将在生命科学与工程大楼设有办公室,最终在卡明顿购物中心24号有一些实验室空间,并在生物系授课。
哈里斯说:“他将在整个大学广泛合作。”“这次招聘从一开始就是医学院和查尔斯河校区的共同努力。”
中科院教授、生物学系主任金•麦考尔(Kim McCall)表示:“他能加入并成为一个领导者,真是太好了。”她指出,中科院最近聘用了三名系统生物学的初级教员。“他的澳门威尼斯人注册网站研究是高度合作的。他已经在和化学系的人交流了。他做过与进化有关的工作,所以他与我们澳门威尼斯人注册网站研究进化生物学的科学家们建立了联系。他对CRC的生物信息学也很重要。”

“生物学的谷歌或Facebook”
“如果你真的想了解细胞,”Emili说,“你必须了解蛋白质分子的作用——它们如何相互作用,它们的功能是什么,它们是如何被调节的。”DNA是密码或原始信息,而蛋白质是构成结构的分子。它们不仅仅是抽象的信息。你可以把他们想象成牢房里的建筑工人。”
他说,他认为他的澳门威尼斯人注册网站研究团队是“生物学的谷歌或Facebook”,绘制蛋白质的社会网络,为蛋白质的功能提供线索。“蛋白质在功能和物理上以非常动态和有趣的方式相互作用,”他说。“这是澳门威尼斯人注册谁认识谁,谁和谁有联系。
他说:“在疾病状态下,这些网络经常受到干扰、修改或以某种方式失效。如果我们想要逆转或预防疾病,我们必须了解这些网络是如何出错的,以及当它被破坏时是什么样子,当它没有被破坏时又是什么样子。”
2015年,德克萨斯大学奥斯汀分校的分子生物科学教授Emili和Edward Marcotte领导了一项具有里程碑意义的《自然》(Nature)澳门威尼斯人注册网站研究,揭示了9种动物物种(面包酵母、阿米巴虫、海葵、苍蝇、蠕虫、海胆、青蛙、老鼠和人类)之间数万种新的蛋白质相互作用。澳门威尼斯人注册网站研究人员利用质谱法分析了每个物种的细胞样本,发现了哪些蛋白质在网络中协同工作,并比较了它们在不同物种之间的结构。他们的图谱提供了这些蛋白质关联如何随时间进化的线索。
“安德鲁的工作与基础和应用生物医学澳门威尼斯人注册网站研究中的广泛问题高度相关,”中科院生物学教授迈克尔·索伦森(Michael Sorenson)说。作为一名进化生物学家,索伦森说,他特别欣赏艾米利2015年在《自然》杂志上发表的澳门威尼斯人注册网站研究,因为它“漂亮地说明了动物多样性是如何通过建立和调整一套共同的基本细胞过程而进化的,这些过程在10亿年或更长的时间里以几乎相同的方式运作。”
Emili从多伦多大学来到波士顿大学,在那里他是分子遗传学教授和安大略省大学理事会生物标志物发现安大略省澳门威尼斯人注册网站研究主席。他也是Donnelly细胞与生物分子澳门威尼斯人注册网站研究中心的首席澳门威尼斯人注册网站研究员和创始成员。他于1997年在多伦多大学获得分子和医学遗传学博士学位,并在西雅图弗雷德哈钦森癌症澳门威尼斯人注册网站研究中心(Fred Hutchinson Cancer Research Center)与诺贝尔奖得主、细胞遗传学家利兰哈特韦尔(Leland Hartwell)一起从事达蒙鲁尼恩/沃尔特温切尔癌症澳门威尼斯人注册网站研究澳门威尼斯人注册网站研究员的博士后澳门威尼斯人注册网站研究,哈特韦尔是该中心的总裁兼名誉主任。在同一时期,Emili跟随John Yates III学习蛋白质质谱,John Yates III当时是华盛顿大学医学院的分子生物技术副教授,现在是Scripps澳门威尼斯人注册网站研究所的化学生理学教授。
“波士顿大学拥有巨大的资源,”Emili说,“鉴于广泛的社区支持,我认为该中心可以跨越式前进,绘制出一些令人兴奋的新领域来宣称和探索。”
“让我们看看这个倡议会带来什么财富。”
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