生物信息学博士
生物信息学博士课程通过计算与数据科学学院为21世纪细胞生物学的科学、工程、医学和伦理学澳门威尼斯人注册网站研究生提供独特的跨学科培训。该计划旨在为分子生命科学领域的学术界和工业界的顶尖澳门威尼斯人注册网站研究人员做好准备。为了被录取,学生至少需要生物信息学相关领域的学士学位,最好是在数学和计算机科学方面有很强的组成部分。
学习成果
获得生物信息学博士学位的学生应该:
- 展示对生物信息学核心概念的掌握:这些包括(a)计算生物学的先进方法,(b)生物化学、分子生物学和基因组学基础的化学原理,(c)关系数据库的设计和实现,(d)概率和统计的基本方法,以及(e)生物系统预测数学模型的构建。
- 能够运用生物信息学的批判性思维和澳门威尼斯人注册网站研究方法来理解计算和实验数据。除了正式的课程之外,这种能力将在(a)论文澳门威尼斯人注册网站研究和(b)科学会议、澳门威尼斯人注册网站研究生研讨会、学生研讨会和资格考试上进行学习和展示。
- 有能力在生物信息学领域进行原创澳门威尼斯人注册网站研究。这一成果最重要的表现是发表同行评议的论文,特别是以学员为第一作者的论文。挑战项目、研讨会报告和会议报告也证明了这一结果。
- 以专业和道德的方式进行学术活动。
- 培养向非技术受众清晰地传达澳门威尼斯人注册网站研究活动的意义、潜在影响和风险的能力,使其对社会具有价值。
课程要求
博士学位总共需要64个课程单元,包括下面列出的36个必修单元,或与其相当的单元,以及额外的选修讲座、实验室和澳门威尼斯人注册网站研究单元。确切的学习课程将与澳门威尼斯人注册网站顾问协商确定,并将反映学生的背景和兴趣。为了获得博士候选人资格,学生必须证明对必修科目的掌握(每门必修课程不低于B)。课程要求如下:
- CAS MA 681定量澳门威尼斯人注册网站研究统计方法加速导论(4单元)
- 计算生物学:基因组,网络,进化(4个单元)
- 选择一门计算机/数学核心课程:
- CAS CS 542机器学习(4个单元)
- CAS MA 770生物信息学数学与统计方法(4个单元)
- CDS BF 571生物网络的动力学和进化(4单元)
- CDS BF 768生物数据库系统(4个)
- 选择一门生物学核心课程:
- CAS BI 565功能基因组学(4个单元)
- 分子生物学和生物化学:分子和过程(4个单元)
- CDS BF 690生物信息学挑战项目(各2个单元);4)
- CDS BF 752科学技术法律与伦理问题(4学分)
- CDS BF 810实验室轮转系统(每套1套,共3套)
- 生物信息学澳门威尼斯人注册网站研究机会(1单元)
- CDS BF 821生物信息学澳门威尼斯人注册网站研究生研讨会(各2个单元)
- 一门非澳门威尼斯人注册网站研究性选修课程(4学分)
- 至少2个澳门威尼斯人注册网站研究单位
必修课程的完成将根据以前的学术和/或工作经验来确定。学生和他们的指导老师将向课程委员会提出申请。当过去的工作或替代课程被接受为必修课程时,学生的顾问将推荐另一门课程来完成36个核心单元小时。高级选修课程应该代替任何被放弃的课程要求。
资格考试
学生必须通过口头资格考试,以推进到博士候选人的水平。考试的目的是让学生展示他们在生物信息学方面的一般能力,以及对他们打算进行澳门威尼斯人注册网站研究的领域的掌握。在论文或论文简介被计算与数据科学学院接受之前,必须通过资格考试的所有部分。
学生必须在第二年的3月31日之前安排资格考试,并在6月30日之前参加考试。第一次考试不及格的学生可以参加第二次考试,考试时间安排在第三年第一学期结束前完成。
语言要求
生物信息学学位没有外语要求。然而,通过口头报告、书面报告和可发表的手稿来确定,基本掌握口语和书面英语是博士学位的要求。
论文和期末口试
候选人应在代表原创性澳门威尼斯人注册网站研究或创造性学术的论文中展示其独立澳门威尼斯人注册网站研究的能力。论文的招股说明书必须由读者、澳门威尼斯人注册网站研究生院主任和系主任/项目主任完成并批准。考生必须进行最后的口头考试,他们捍卫自己的论文作为一个宝贵的贡献知识在他们的领域,并证明他们的专业领域的掌握与他们的论文。论文和期末口试的所有部分必须按照哲学博士学位的GRS一般要求完成。CDS使用与GRS相同的需求。
完成要求的核心课程,但不能成功完成博士学位所有要求的学生将有资格获得硕士学位。